兒童醫學及健康相關資料庫
兒童與青少年行為之長期發展研究計畫（ Child and Adolescent Behaviors in Long-term Evolution, CABLE）
為了解學童的生活型態及身心健康相關行為每年的盛行率、發生率和長期改變的情形，同時從學童本身的特質，以及家庭、同儕、學校、社區、媒體等多面向，找出影響學童身心健康發展的相關因素，自2001年開始，以台北市和新竹縣兩地公立小學國小一年級和四年級的學生，逐年追蹤至2011年。
PACE活力計畫
由教育部指導、陽明大學主辦的「推動中小學生健康體位五年計畫」，關注對象從過去的預防過重與肥胖學生，擴展為全國中小學生身上，藉由正確體型意識的教育，推動動態生活及健康的飲食習慣等三大主軸，除了改變學生的生活型態，並減少肥胖所產生的相關疾病，更積極地建構一個健康的校園環境。此活力計畫提出Aid students to fit 的口號，以及健康體位金三角觀念（AID），並運用五大策略加以推動。其研究對象是針對18歲以下之兒童及青少年，以學校為單位，進行衛教宣導，以前後測的方式分析學生是否於衛教宣導後於85210(8:每天睡滿小時、5:每天5蔬果、2: 4電少於2、每週運動210分鐘、1: 每日喝足白開水1500CC)方面的進步與否。
國民健康訪問調查(National Health Interview Survey, NHIS)
為了了解國人健康狀況及服務需求、探討重要健康議題及相關因素、界定衛生保健計畫目標族群、提供健康政策與計畫訂定依據、評估健康政策及計畫成效。其國民健康訪問調查收集國人健康狀況、健康行為以及醫療保健服務利用資料，陸續於2011年、2005年、2009年、2013年，採多階段分層系統抽樣設計針對台灣地區23個縣市進行問卷調查，問卷依年齡層分為未滿12歲、12～64歲以及65歲以上等三類。
衛福部現有與兒童、青少年相關的大型調查或資料庫
包含大型調查 (a.出生通報、b.兒童健康照護需求調查、c.青少年保健調查、d.兒童及少年生活狀況調查、e.台灣國民營養健康狀況變遷調查)及開放之資料平台(a.產檢、b.新生兒健康、c.母乳哺育、d.口腔衛生、e.菸害防治、f.身體活動)。
台灣青少年成長歷程研究(Taiwan Youth Project, TYP)
要由中央研究院社會學研究所支助，透過長年的觀察，期望能了解台灣青少年成長的過程，並試圖由家庭、學校和社區等三個重要社會制度的交互影響切入，以期能由社會學的角度，勾勒出臺灣青少年從國中邁向成人階段的完整發展軌跡與生命歷程。
台灣教育長期追蹤資料庫(Taiwan Education Panel Survey, TEPS)
由中央研究院、教育部、國立教育研究院籌備處和國科會共同資助，並由中央研究院、社會學研究所和歐美研究所共同負責規畫與執行的一項全國性長期的資料庫計畫。本調查計畫以問卷調查方法來收集資料，焦點放在學校及家庭學習環境（制度及社會面向）對學生的影響上。研究者提供多面向、長期追蹤的資料。資料範圍包含學生個人、班級和學校等多層次由於近年來教育制度的更迭，本調查對兩個年級（共約四萬人）的學生收集的資料，可以讓未來的分析有準實驗設計的可能性。更重要的是，這個資料庫在資料收集和整理完成後，隨即會對外公開，成為學界和政策制定部門的共同資產。
「台灣教育長期追蹤資料庫」後續調查：教育與勞力市場的連結(Taiwan Education Panel Survey and Beyond, TEPS-B)
由國立政治大學、國立台灣大學及中央研究院等共同組成之研究團隊，其計畫目標即為繼續追蹤這些年輕人就學就業的現況。TEPS-B期望透過資料庫的累積，描繪出這一世代年輕人的生命歷程。在來，這批珍貴的資料，將可作為教育及人力資源等政策規畫的重要基礎。
「臺灣出生世代研究」（Taiwan Birth Cohort Study，TBCS
由行政院衛福部國民健康署委託進行的一項全國性長期追蹤研究。主旨在透過生命歷程，以及流行病學觀點，收集與成人健康有關之生命早期環境因素等實證資料，藉以整合相關專業領域之人力與社資源，作為未來營造有益於兒童健康、兒童照顧與成長環境設計的依據。而具體目標包括：(a)建立新世紀台灣兒童的生長發育與健康狀況常模；(b)探討社會環境對兒童健康與發展的影響；(c)研究童年健康與成人健康的關係。
教育部學生健康檢查資訊系統
教育部為整合全國高中、職與國民中、小學學生年度健康檢查資料，所建置之資訊平台，以利學生健康資料的收集與管理。
兒童心臟病資料庫
中華民國心臟病兒童基金會設立心臟病兒童登錄中心，以登錄篩檢出心臟病學童資料，更收集各大醫院的小兒心臟病例，予以登錄，協助病童的轉診與管理。登錄中心資料庫的建立，有助於小兒心臟學的教學與研究。
幼兒發展調查資料庫（Kids in Taiwan: National Longitudinal Study of Child Development & Care, KIT）
在科技部經費的補助下，由國立師範大學教育研究與評鑑中心及人類發展與家庭學系，結合國內幼兒發展、幼兒教育、家庭教育、教育心理、早期療育、臨床醫學、調查研究等領域學者組成研究團隊，並邀請國內相關領域資深學者擔任諮詢顧問、合力建置國內幼兒發展資料庫。幼兒發展資料庫計畫的整體目標在建置完整、正確且具時代和本土文化意義的我國0-8歲幼兒發展長期追蹤資料庫，其目的是為了了解我國幼兒從出生至八歲健康、認知語言、社會情緒、身體動作發展的歷程和變化，幼兒所處家庭和教保環境的狀況，以及家庭和教保環境對幼兒發展的長遠影響，也與他國相關研究比較，以探討我國幼兒的發展趨勢和變化以及環境經驗與他國幼兒的異同，以對人類發展的本質作更深入的瞭解，並提供政府擬定我國兒童健康、福利、家庭、托育、早療等政策的參考。
